Infatti l'anzianità è un vantaggio indiretto, non diretto. Il fatto che non riesca ad essere rilavata non è un danno per il sito.
Come dici giustamente te più anziano è il sito maggiore è la possibilità di essere conosciuti e di ricevere backlink, ma non è che se questa data non viene rilevata il sito viene considerato nuovo. Infatti ci sono altri modi per capirlo, ad esempio la data di modifica di un documento, la data di rilevamento dei backlink, lo stesso whois che funziona. Google ha moltissimi strumenti che usa e non mi concentrerei troppo su questi dettagli, piuttosto andrei a sprecare le energie su altri punti.
Per quello che riguarda i software preferisco quelli che danno i dati grezzi, che poi elaboro io di caso in caso.
Per fare un esempio banale parliamo del tag title. Il 99% dei software controlla la lunghezza, quindi se ho un tag di 10 caratteri mi dice che è errato, se lo ho di 68 mi dice che è giusto, peccato che quello di 10 caratteri contiene il nome del brand e quello di 68 contiene tutte i. Capisci benissimo che dati i due casi dovrebbe segnarmeli entrambi sbagliati o almeno il secondo, mentre non è così.