Secondo me può succedere invece.
Fino a qualche mese fa il meccanismo di trasferimento con il redirect 301 generava casi in cui le nuove pagine venivano correttamente indicizzate, le vecchie correttamente eliminate ma i buoni posizionamenti sparivano.
Personalmente ho fatto alcuni esperimenti, ma il fatto che GG non mostri tutti i backlink ad un documento in questo caso è davvero penalizzante.
Io, nel caso in cui le pagine ricevano backlink esterni non trasferibili manualmente ai nuovi documenti, ci andrei con i piedi di piombo.
Ed anche potendo trasferire tutti i backlink non mi sorprenderebbe qualche peggioramento nel breve-medio periodo.
In poche parole non mi è chiaro se il meccanismo di "maneggiamento" del 301 trasferisca correttamente i backlink ed eventuali dati storici associati ai documenti.