Ho guardato il sito è con firefox in alcune voci del menù mi esce la scritta
User-agent: * Disallow:
Altra cosa che mi insospettisce sono quegli url che finiscono con 1
Hai cambiato i permalink per caso?
Questo problema è uscito fin da subito quando hai caricato il sito?
Visto che non pare sia indicizzato io cancellerei il database e reinstallerei il tutto cambiando quei permalink.