Ciao Alex93,
presumo che ti riferisca alla non applicabilità dell'Iva da parte dell'impresa venditrice decorsi 5 anni dalla costruzione/ristrutturazione dell'immobile.
In questo caso al posto dell'Iva verseresti l'imposta di registro agevolata al 3%, quindi sarebbe addirittura meglio per te.
L'importante è rispettare i requisiti che la legge richiedere per considerare l'immobile prima casa.