Non esiste nessuna regola di favore per il commercio elettronico rispetto al commercio tradizionale. Dunque applicare o non applicare l'IVA è legato alle norme consuete.
Ma la normativa di riferimento che domandi, è qualcosa di enorme, anche perchè varia a seconda del tipo di attività e della localizzazion del cliente... mi pare poco intelligibile per un profano... ti servirebbe un commercialista. Per quella che è la mia esperienza, è proprio sui rapporti con soggetti esteri che il contribuente fai-da-te sbaglia più spesso.
Comunque, prova a guardare il D.P.R. 633/1972, per cominciare.