Ciao,
fermo restando che molti merchant sono MOLTO poco trasparenti, e che ho avuto contatti con gente che considera pressappoco una "razza inferiore" i webmaster con cui lavora, mi permetto di fare un paio di osservazioni forse interessanti per il tuo caso:
la discrepanza tra visite rilevate dal merchant e visite puo' darsi che sia dovuta al fatto che tu ti riferisci alle visualizzazioni (impression, numero di volte che una pagina viene visualizzata in assoluto o a prescindere dall'utente) mentre il merchant ai visitatori unici.
i rapporti di conversione che citi a me suonano abbastanza familiari, siamo nella "normalità" non remunerativa: mi è capitato a volte di avere MIGLIAIA di impression e NESSUNA iscrizione su un paio di white-label, pur essendo nicchie molto promettenti. Probabilmente, in questi casi, c'è qualcosa che non va a livello di presentazione della pagina - ovviamente parlo per esperienza, nulla di "dogmatico".
se la contestualizzazione non basta a generare vendite, puo' anche darsi che tu debba rivolgerti ad altri mercati: di solito i "bisogni primari" degli utenti sono quelli che rendono meglio (un hosting dedicato di per sè piuttosto che un manuale di configurazione hosting dedicati). In Italia si legge poco e puo' darsi che il problema sia questo...
Spero di essere stato chiaro ed utile