Ciao Wookie,
io sono appena uscita da una penalizzazione come la tua per link innaturali alla terza richiesta di riconsiderazione.
Quello che ti consiglio di fare è mettere il nofollow a tutti i link esterni del tuo sito e anche ai banner.
Controlla bene tutti i link in entrata tramite strumenti per webmaster.
Il disallow tool è molto lento secondo me, quindi dopo aver verificato tutto ed essere sicuro di aver incluso tutti i link cattivi, manda la richiesta di riconsiderazione spiegando bene tutto quello che è successo, le operazioni che hai fatto e inserendo anche i link di tutti i siti inclusi nel disallow.
Se non sei riuscito a contattare i webmaster di alcuni siti scrivilo. Scrivi tutto insomma. Cerca di essere più chiaro possibile sulle azioni intrapprese su link in entrata e uscita.
Controlla pagina per pagina e verifica che non ci sia keyword stuffing nel testo.
Lo strumento per webmaster non è in tempo reale quindi non preoccuparti.
Se ricevi notifiche di errori 404 se puoi fai dei redirect, altrimenti se sono pagine troppo vecchie e inutili segnalale come corrette.
Buona fortuna!