dai un nome uguale per ogni finestra, così si aggiornerà sempre la stessa popup..
Esempio:
<html>
<head>
<title>titolo pagina</title>
<script type="text/javascript">
function apriFinestra(c)
{
window.open(c, "nomePopUp", "top=10, left=10, width=400, height=250, status=no, menubar=no, toolbar=no scrollbar=no");
}
</script>
</head>
<body>
<a href="javascript:apriFinestra('contenuto1.html');">link 1</a><br />
<a href="javascript:apriFinestra('contenuto2.html');">link 2</a><br />
<a href="javascript:apriFinestra('contenuto3.html');">link 3</a><br />
</body>
</html>
Nel tuo caso:
<a href="#" onClick="MM_openBrWindow('popup.htm','nomeFinestra','toolbar=y es,top=200,left=350,width=320,height=250')">Docume nto senza titolo</a><br>
nota il secondo argomento passato alla funzione MM_openBrWindow()..