Manomettere il core di un'estensione per far credere a WordPress una cosa diversa non è molto saggio.
Ma a parte questo, la nuova versione qTranslate X è praticamente la stessa che stai utilizzando, con la differenza che mentre la tua versione è abbandonata da tempo e l'autore originale è scomparso (è subentrato l'autore "chineseleeper", autore anche della nuova versione X), la nuova ha corretto numerosi malfunzionamenti, soprattutto potenziali falle.
Ti consiglio quanto prima di "migrare" nella nuova versione

Edit:
Copio e incollo l'avviso presente nella nuova versione X:

This plugin is a descendant of qTranslate, which has apparently been abandoned by the original author, Qian Qin.

Sinceramente pensavo fosse più semplice poter creare un sito multilingue. Io vorrei incasinare il database il meno possibile e non aver troppi problemi in generale. Mi consigli quindi di installare qTranslateX?

Se quello che cerchi è incasinare il meno possibile il database, allora la soluzione è quella di avere un'altra installazione separata di Wordpress.
Crei una cartella IT ed installi un nuovo Wordpress, magari mettendo lo stesso template, stessi widget etc. Così da avere ogni cosa separata ed evitare spiacevoli errori. ( fai lo stesso per FR )
Purtroppo i plugin di traduzione, aggiungono parecchi testi separatori di lingua un po' ovunque: descrizione, titolo, meta tag, categorie, widget etc.

In questo modo hai un sito o più siti fotocopia di quello originale

In questo modo, avrò problemi di SEO?

Avendo le cose separate, anche il seo sarà separato. Quindi il sito principale non risentirà di nulla.

@daniele7 said:

Sinceramente pensavo fosse più semplice poter creare un sito multilingue.
Purtroppo non è proprio semplice, poi il plugin che ti ho consigliato, WPML, richiede un certo periodo di apprendimento, non è proprio una passeggiata anche se le ultime versioni hanno automatizzato un bel po' di parametri.
Sono d'accordo anch'io con il consiglio di Ultima sull'installazione di un "doppio" sito.

L'unica cosa che dovrò avere a disposizione 3 database differenti giusto? Cosa che per ora non ho.

Assolutamente no! Nel file config.php puoi scegliere il prefisso delle tabelle di Wordpress che di solito è wp_
Ti basta cambiare quello ed il gioco è fatto. Ovviamente per altre 2 installazioni ti consiglio di usare IT_ e FR_

Perfetto ho fatto una prova e funziona. Voglio però porvi un quesito.

Per il mio sito in wordpress, ho creato un tema da zero e ho creato le varie pagine utilizzando i template personalizzati. Quindi se creassi la homepage in francese come una qualsiasi altra pagina, e la collegassi alla homepage in inglese attraverso un link attivo non potrei risolvere il problema?

Spero di essermi spiegato, se posso magari sarebbe utile mettere il link del sito giusto per farvi capire.

Non è molto chiaro, ma se lo scopo è crare un sito multilingua il senso è che tutti gli oggetti devono essere tradotti nelle varie lingue, dai menu ai form contatti eccetera, tutto.
Se la tua esigenza è solo quella di avere alcuni contenuti in lingue diverse allora il multilingua non ti serve, basta che per ogni contenuto offri un link allo stesso ma tradotto in altra lingua.

@daniele7 said:

Perfetto ho fatto una prova e funziona. Voglio però porvi un quesito.

Per il mio sito in wordpress, ho creato un tema da zero e ho creato le varie pagine utilizzando i template personalizzati. Quindi se creassi la homepage in francese come una qualsiasi altra pagina, e la collegassi alla homepage in inglese attraverso un link attivo non potrei risolvere il problema?

Spero di essermi spiegato, se posso magari sarebbe utile mettere il link del sito giusto per farvi capire.
Certamente!
Però la homepage in francese deve risiedere nell'installazione del Wordpress in francese

Ciao a tutti, pure io sto creando un sito che multilingue! Però con qTranslate ho dei problemi a tradurre il titolo e la descrizione dei media! Sapete se con qTranslate X il problema è stato risolto ?
Grazie