Prova a vedere ora dovrebbe andare.
<html>
<head>
<title>prova</title>
<script type='text/javascript'>
function Domanda(link, tipo,stile)
{
var domanda;
switch(tipo)
{
case 'A':
domanda = "Sicuro di fare questo?";
break;
case 'B':
domanda = "Sicuro di fare quest'altro?";
break;
}
var answer = confirm(domanda);
if(answer)
{
window.open (link,"mywindow",stile);
}
}
</script>
</head>
<body>
<input type="button" value="apri" onclick="Domanda('google.it','A','top=100,width=100');" />
</body>
</html>
Una sola cosa per motivi di protezione non mi fa scrivere correttamente l'url quello modificalo te correttamente.