Dipende dal regime contabile adottato. Inoltre, il numero di fatture è solo uno dei parametri (per quanto importante). Io per esempio, in genere mi faccio pagare caro in proporzione alle rilevazioni contabili (a meno che non ci sia un prezzo forfettario concordato), ma questo perchè altre prestazioni sono del tutto gratuite, o meglio, il "pacchetto" ricomprende tutto.
E credo che ogni professionista, in linea di massima, si organizzi a modo suo con propri parametri.
In tutti i casi, il punto di riferimento ineludibile (almeno verso l'alto) è il tariffario dell'Ordine (D.Lgs 169/2010). Alla tenuta della contabilità è dedicato l'articolo 33, nell'ipotesi di onorario specifico e non preconcordato.