Salve,
è vero, SEO di Yoast non è magico, ma ti permette di gestire i meta Tag con semplicità e inoltre io sono un sostenitore del semaforo verde, anche se molti dicono che non serve a nulla. E' chiaro che non è uno strumento oggettivo, ma è un indicatore e un promemoria, che può permettere di effettuare delle migliorie nei contenuti, senza per questo essere paranoici sul fatto che se il semaforo non è verde allora vuol dire che il SEO fa schifo.
Detto questo, con uno sguardo veloce, secondo me il sito è abbastanza curato dal punto di vista del SEO. Mi permetto solo di farti notare che manca la cura dei tag ALT delle immagini e le immagini stesse sono troppo pesanti. Per i formati delle immagini scegli JPG piuttosto che PNG, perchè è più leggero pur mantenendo ottima qualità. 263kb per un immagine di 600x330 px (dna-lettura-660x330.png) sono troppi. Un immagine come questa, sfumata e con cosi pochi dettagli, dovrebbe pesare circa 30kb, quasi un decimo! La velocità di caricamento è un fattore importante anche per l'indicizzazione, oltre che per la navigabilità. Puoi utilizzare software compressori anche gratuiti che trovi online.
Il tag ALT poi deve contenere un semplice testo alternativo e non un intera descrizione. Nel caso specifico dell'immagine che ho portato come esempio, meglio semplicemente "Analisi e DNA editing" invece dell'originale "La Bioinformatica applicata alla lettura, analisi e al DNA editing permette di conoscere, prevenire e curare le varie patologie umane". In altri casi ho visto che il tag ALT invece contiene solo una singola parola oppure è completamente vuoto.
Una maggiore cura di questi dettagli può sicuramente aiutare ulteriormente l'indicizzazione del sito.