Anche whishlist potrebbe essere attivato da un plugin, perchè woocommerce nativamente non dovrebbe averlo.

Yoast ha un esetnsione (a pagamento) per woocommerce, devi capire se fa akla caso tuo: yoast.com/wordpress/plugins/yoast-woocommerce-seo/#utm_source=wordpress-seo-config&utm_medium=banner&utm_campaign=extension-page-banners

probabilmente invece il problema è relativo al plugin wishlist: vedi qualìè e cerca info sulla pagina dello sviluppatore el plugin

vedi se riesci a bloccare le url (es xxx/wishlist/xxx ) da robots.txt

Nessun problema, il redirect si può fare con o senza suffisso.

Se vuoi modificare il file .htaccess senza intaccare quello della ROOT ti basta crearlo sulla sottocartella dove vuoi che abbia effetto, il file .htaccess ricorda però che ha un livello di eredità che parte dalla root fino alle sottocartelle, ma se comunque ne specifichi uno nuovo puoi cambiare le regole esistenti in regole nuove, senza fare impazzire il sistema.
Immagina che quando crei un file .htaccess su una cartella, esso avrà validità salvo nuovi .htaccess su tutte le sue sottocartelle.

Ragazzi ma la questione che ho sollevato non è interessante? Nel vostro pannello quelle quattro voci duplicate (che io ho evidenziato con le freccie rosse) le vedete?

devo fare un precisazione, correggetemi se sbaglio:

nel mio caso, spesso le categorie non sono così numerose; in ogni pagina "categoria" sono presente molti articoli proposti solo in maniera sintetica (il famoso "read more") spesso le categorie indicano una key secca per la quale si interessa posizionarsi (es: www....com/category/iPhone5, o meglio ancora www....com/iphone5/ nei post c'è il "rel=canonical", che indirizza i motori verso i contenuti originali evitando duplicazioni.

Se questi sono i presupposti, perchè non indicizzare e promuovere le pagine categoria?

Se non erro, la gestione Robots la puoi gestire dalla impostazioni o in alternativa carica un file robots.txt reale.
Riguardo al tuo caso, lascia inalterato questo:

User-agent: *
Disallow: /wp-admin/
Disallow: /wp-includes/

è corretto.

Non ho capito questo

"Oggi in Strumenti x webmaster vedo questo:
dl.dropbox.com/u/62605175/urlbloccato.png"