Io non mi preoccuperei tanto del controller, comunque credo che averne uno di scorta, se possibile, non possa far male.
Per vedere come funzionano, basta cercare su youtube "controller raid" o "array raid", di video ce ne sono molti e in tante lingue, non so quali tu conosca.
Il sistema operativo (sia che sarà un raid 1 che un raid 5, sarà installato su tutti gli hard disk, poichè questi verranno visti dal sistema operativo come un unico disco di capacità che dipende dal tipo di raid scelto.
Come ho detto più su, nel raid 1 la capacità disponibile sarà pari a quella del disco più piccolo, nel raid 5 si calcola in un altro modo (mi sembra sia pari a quella degli n-1 dischi, con n= numero dischi usati).
Pertanto, se si rompe il pc, attacchi controller e dischi a quello nuovo e sei a posto (magari dovrai fare un aggiornamento dei driver, ma è fattibile).
Come controller raid non sono espertissimo, ma marche come adaptec e promise le ho sentite spesso. Che sistema operativo ci sarebbe?
Comunque vorrei farti presente che, per quanto un minimo ferrato in materia, declino ogni responsabilità su esplosioni nucleari e affini...