Ciao
premettendo che puoi modificare le categorie come preferisci andando a modificare il tema del sito, alcune cose le puoi fare cliccando su personalizza mentre per altre serve un tema figlio.

Purtroppo ho qualche difficoltà a capire quello che descrivi, puoi rispiegare il problema mettendo anche le url di riferimento? Le url scrivile in questo formato con gli spazi sito . it

Il problema è innanzitutto comprendere come si intenda utilizzare e differenziare tag e categorie, in base al sistema di classificazione utilizzato. Ad esempio, su un blog di auto, potresti inserire categorie: monovolume, berlina ecc. ed usare i tag per i nomi o i modelli di vetture. Pianifica tutto a tavolino.

Se stai utilizzando blog wordpress esistono diversi sistemi (da plugin o da phpmyAdmin) per il restyling di categorie e tag, così puoi velocizzare le operazioni. Ricorda anche di effettuare i redirect 301 delle pagine tag o categoria eliminate, che magari ti portavano traffico o erano posizionate.