Hai ragione, installare plugin su windows può essere molto complicato se hai a disposizione solo dei sorgenti da compilare. Poiché ricreare un ambiente di compilazione sotto windows richiede davvero molto lavoro:
http://wiki.gimp.org/gimp/HowToCompileGimp/MicrosoftWindows
ti consiglio di cercare plugin in versione binaria (davvero rari) o in versione script-fu; per queste due tipologie trovi una guida online qua:
http://www.volalibero.it/plugin_scriptfu_per_gimp.html
Se invece vuoi davvero provare a compilare i sorgenti, continuiamo in questa discussione, così ti possiamo fornire del supporto
Ciao