Spesso capita anche che senza alcuni plugin non si veda tutto il tema. A me capitava su temi tipo "remedy", quelli stile magazine. Comunque, come dice Teju, è probabilmente la compatibilità del tema con la tua versione di WP. Tanti temi sono stati fatti per versioni precedenti, se usi l'ultima spesso non vedi nulla, perchè mancano funzioni nuove.
Potresti provare a confrontare il codice con i temi di default, e vedere cosa cambia. Magari è solo qualche funzione con nomi vecchi semplicemente da modificare. Non ci ho mai provato però.