Ciao Andromedia,
guarda, secondo me se diventa scomodo per gli utenti ha poco senso, poi devi anche valutare in che posizione sono i menu: un menu in cima a tutte le pagine non può essere strutturato male poiché è troppo visivamente rilevante!
Prova a postare qualche keyword che vorresti mettere nel tuo sito così vediamo..
Io comunque sono dell'opinione che prima di tutto viene la User Experience, soprattutto per progetti a lungo termine: Google vuole semplicemente dare agli utenti risultati di qualità, se tu fai di tutto per fornirgli un risultato di qualità anche se l'algoritmo cambia sei sempre aggiornato, non fai altro che portarti avanti con i tempi, no?
Tutto IMHO ovviamente
Paolo