@drintro13 come fare i redirect dipende se devi solo migrare le URL da sottodominio a cartella... o hai proprio una struttura differente perché cambia il software (cosa che immagino sia il tuo caso).
Nel secondo caso è un pelo più complicato perché devi appunto fare i redirect uno per uno... e di solito è buona norma trovare un automatismo ad esempio tramite regole RegEx che ti permettano di raggruppare e definire le regole per gruppi di URL.
Io nel tuo caso farei tutto nell'htaccess del dominio shop.nomesito.it, purtroppo non sono familiare con il plugin che menzioni e per capire come fare i redirect in concreto è necessario vedere il caso specifico.
Più in là di così non possiamo spingerci
