Google dichiara:
Una Sitemap è un file contenente un elenco delle pagine web del tuo sito da far sottoporre a scansione ai web crawler come Googlebot. Anche se la maggior parte dei web crawler è in grado di esplorare il Web e trovare tutti i file del tuo sito, la Sitemap agevola i crawler...
Dipende da quel'è il desiderata. Se volete solo che non venga indicizzata quella macro area, quindi "noindex" e stop, per Google di default è "follow", quindi seguirà i link. E' questo l'obiettivo? Vi interessa vengano comunque seguiti i link di quelle pagine?
Se per voi invece quell'area è inutile da tutti i punti di vista (come mi pareva di aver capito), allora è "noindex,nofollow" e quindi a mio avviso non va in sitemap.