Ciao Giorgio!!
da quanto tempo...;)
dunque come pattern posso dire che ho notato che, per alcune chiavi abbastanza competitive, sono stati penalizzati o del tutto scomparsi alcuni siti ospitati in sottodomini di altervista.org
Siti che spammavano parecchio ("keyword stuffing" principalmente) ...

Devo ammettere però che ciò non ha intaccato siti veri propri (con un dns prorpio) che hanno oramai una certa età/autorevolezza/traffico ma che continuano a spammare con footer pieni di link spammosi per le key più competitive...

In caso di backend non disponibile il web server di front-end dovrebbe rispondere a Googlebot (e agli utenti) un eccezione HTTP error 503 (service is unavailable), ma se non è possibile (perchè ad esempio il server di front end è lo stesso del server di backend), fintanto che il tuo sito web è inattivo per un breve periodo di tempo, non dovrebbe influire troppo sul ranking del tuo sito web, a parte le prime settimane dopo i tempi di inattività.
Dopo un pò Google reindicizzerà il sito, soprattutto se provvederai a risottoporre una sitemap.xml aggiornata