Si, il 63.99.00 potrebbe essere un'idea anche se, a mio avviso, si riferisce più a servizi di informazioni "cartacee".
Un'altra idea potrebbe essere il 63.12.00 "Portali web". Nella descrizione di questo codice Ateco c'è scritto "gestione di altri siti che fungono da portali internet, quali siti di media che forniscono informazioni aggiornate periodicamente"
Per quanto riguarda la pubblicità, intendi dire che metteranno dei banner sul sito? In tal caso puoi usare il 73.12.00.