Ciao Metsu,
penso nessuno perché le informazioni contenute nel codice di embed, a quanto mi sembra di capire, non cambierebbero. Quindi quello che aggiunge l'inserimento da Wordpress è solo qualcosa che influisce sull'aspetto del player e non su caratteristiche SEO che potrebbero quindi determinare delle differenze :).
Il link verso il video di YouTube esiste in entrambi, quindi puoi utilizzare l'uno o l'altro. Se ti è più comodo utilizza il metodo Wordpress così non hai bisogno ogni volta di modificare le impostazioni di embed per ogni singolo video.
Ciao,
A.