Succede ad esempio quando viene stampato un iframe via javascript senza prevenzione cache.
Da quel che ho capito l'errore è causato dal browser che si "ricorda" dell'ordine degli iframe invertendone la posizione in fase di reload.
Ora, dato che non ho controllo sull'output di concessionarie pubblicitarie esterne e non posso aggiungere parametri random o date all'SRC, che mi suggerite?