@claudio-braccianti come è stato detto non va bene duplicare i contenuti ed effettivamente l'architettura dei due siti così mixati un po' confonde.

Se lo scopo è spingere di più l'e-commerce opterei per una soluzione ibrida portando i contenuti istituzionali sullo shop e trasferendo il tutto sulla root.

Condivido quanto detto da @shazarak
Se l'obj è quello di fare un bel sito e vendere corsi, non hai mai usato wordpress e non vuoi perdere troppo il sonno collegherei semplicemente al sito vetrina una piattaforma che fa tutta la parte di e-commerce e gestione corsi... di piattaforme ne esistono moltissime come per esempio https://teachable.com/