Ciao Laura,
forse non ho ben capito: tu hai 1 profilo (quindi un codice analyics diverso) per ogni dominio e sottodominio, giusto?
Oppure hai un unico codice e poi in analytics hai impostato un filtro che includa solo il traffico su un dominio/sottodominio specifico?
In secodo luogo hai un profilo generale dove vedi tutte le statistiche di tutti i domini indistintamente?
Da quello che hai scritto credo che il problema sia proprio in questo ultimo punto, ovvero che non hai un profilo che racchiuda tutte le visite in modo distinto.
Se così fosse non devi fare altro che creare un profilo senza alcun filtro su dominio e sottosominio, oppure creare un nuovo profilo (magari da inserire in un account separato) con un ulteriore codice che andrai ad inserire in tutti i siti e sul quale non applicherai alcun filtro.
Scusa se chiedo la precisazione ma non è molto chiaro. Grazie!