Premetto che non ho mai affrontato il caso.
Tuttavia credo abbia ragione l'ufficio. L'unica soluzione è convincere l'ufficio della propria buona fede e sperare che ci sia la volontà dell'ufficio di passare sopra la cosa.
Viceversa tuo fratello avrà un credito d'imposta e tu arai perso i benefici della rivalutazione.
In tale ultima ipotesi verifica se puoi rivalerti sul perito o su chi ti ha fatto versare meno, esistono le assicurazioni professionali che coprono queste problematiche.

Fabrizio