La risposta è una sola, "no non influisce" per lo meno fino a quando Google non si doterà di strumenti di rendering per visualizzare le pagine come le vedono i navigatori.
E anche in quel caso non può portare a ban, semmai ad ignorare ciò che è poco visibile.

Conta l'intenzione, ma l'intenzione è difficile da determinare, in sostanza chi mi dice come devo usare il DHTML (che, per inciso, non è testo nascosto)?