Se scegli il regime ordinario, per ora non devi fare niente di particolare.
L'anno prossimo presenterai la dichiarazione IVA e comunicherai di aver optato per esso (si comunica, infatti, a cose fatte).

Naturalmente dovrai seguire tutti gli adempimenti propri del regime contabile ordinario (fatturazione con addebito IVA, registrazioni, liquidazioni periodiche...)

Su cosa sia più conveniente è difficilissimo dirlo a priori, bisognerebbe fare conteggi molto dettagliati.
Magari ora parti col regime dei minimi, alla peggio potrai cambiare in futuro.