In realtà non esiste nessuna key "notti", bensì SUM(notti), per farlo funzionare come vuoi tu dovresti dare un nome a quella somma di coseguenza la query dovrebbe essere così:
$query = " SELECT SUM(notti) as sommaNotti FROM notturni WHERE abitante = '$cod' and data_entrata > '$newdate' ";
per stampare poi:
echo $row['sommaNotti'];