Non esiste nessuna guida del genere. Per amministrare un server devi avere conoscenze approfondite dei programmi/server da utilizzare oltre a conoscenze più o meno approfondite del sistema operativo, dei meccanismi di rete,dei sistemi che fanno funzionare internet.
Se ti interessa solo fare l'upload dei tuoi file, allora devi configurare il server ftp e imparare a configurare il web server.