Eh allora devi stare attento ai redirect 301 prima di fare qualunque modifica
Son cose che di solito è bene sistemare prima!

Ma chi ti ha consigliato di non toccarla? Mai visto un sito in Joomla con quel /index.php/

aaa.ma l'ha consigliato l'internet...credimi non ricordo..cmq..secondo te dovrei rimuovere index . php e poi lavorare di redirect?

Sì, quella cosa è inguardabile. Però avresti comunque il problema dei duplicated content, dovresti verificare i rel="canonical". Mi dai l'indirizzo del sito?
Comunque cosa intendi per online "da un bel po'"? Joomla 3 non è uscito da molto

C o m p u t e r e g a m e s . it
cmq.. Penso di puovermi cosi..ci dovrebbe essere un comando per .htaccess che potrebbe fare al caso mio per quanto riguarda il togleriere l'index dal url e farmi il redirect in automatico.

No, l'index.php va rimosso settando l'URL rewrite nella conf di Joomla! Non ci sarà nemmeno bisogno di toccare htaccess (eccetto abilitare quello di default Joomla) in quanto sarà Joomla stesso a settare i rel="canonical" e quindi a evitare i contenuti duplicati.
Comunque il tuo sito ha un po' di problemi a quanto vedo, intanto non è per nulla ottimizzato SEO (a partire dai Title, la prima cosa che ho notato, e le description terribili ), e poi cosa sono quelle A con l'accento circonflesso che si vedono un po' ovunque?
Il mio suggerimento è di assumere qualcuno che possa farti una consulenza SEO completa, se non sai dove mettere le mani

per quanto riguarda la a' questo è chromium..vacci con Gecko.......lo devvo correggere..poi che hanno i title che non vanno??

scusami...ma devo farlo io...almeno che qualuno non si muovi per qualche spicciolo..

Dimmi che miglioreresti tu per adesso...grazie...e non rispondere tutto per favore....:)

Usa un editor testuale anziché grafico così non hai il problema dell'A accentata

I title non sono ottimizzati SEO, quello della pagina "Nokia" è semplicemente "Nokia", quando potrebbe essere qualcosa tipo "Riparazione smartphone Nokia a Palermo | Computeregames.it" o qualcosa del genere, così come quella "Formattazione" puoi mettere "Formattazione Computer a Palermo | Computeregames.it"

C'è molto lavoro da fare su quel sito, puoi imparare da te ma ti conviene metterti a studiare

grazie..ma per le pagine duplicate?

Inizia a mettere il mod_rewrite! Vedrai che Joomla metterà i canonical da sè

scusami..ma perchè viene abilitato solo con il mod-rewrite?