Non avevo capito questo passaggio. Modificherò le virgolette

Riscontro un'altro problema riguardo la favicon. Nella home page risulta della grandezza voluta mentre quando apro gli articoli diventa nuovamente piccola, come mai?

Impossibile che succeda, essendo la favicon una sola, richiamata nell'header che è lo stesso per tutte le pagine e post.
Io la vedo sempre uguale su 4 browser differenti, prova a pulire la cache del tuo browser.

Dopo aver pulito la cache di chrome e firefox adesso quando clicco su un articolo la favicon scompare (compare un pagina bianca). L'unico che visualizza correttamente la favicon anche negli articoli è internet explorer. Ho provato con altri 2 computer utilizzando chrome è dà lo stesso errore (pagina bianca come favicon nella visualizzazione degli articoli).

Anch'io, avendo per scrupolo pulito la cache, la tua favicon invece continuo a vederla. Non so spiegarmi perchè a te non succeda lo stesso.
Prova a cambiare tipo di favicon seguendo queste istruzioni, magari cambia qualcosa.
kevinleary.net/how-to-add-cross-browser-favicon-website/

Mi sono accorto di un'altra cosa controllando sempre la tua sorgente, che tu non hai messo il codice consigliato da wordpress che è questo.
[PHP]<link rel="shortcut icon" href="<?php bloginfo('stylesheet_directory'); ?>/favicon.ico" />[/PHP]
No so se abbia valore ai fini della visualizzazione ma io utilizzo sempre questo e non ho mai avuto problemi.

Ovviamente con quel codice la favicon non la devi mettere nella root di wordpress come hai fatto ora, che al primo aggiornamento sparirebbe, ma nella root del tuo tema, (anche se per te, che usi il tema di default, al primo aggiornamento avrebbe lo stesso risultato).

Nel mio caso quindi metto la favicon in public_html/wp-content/themes/Twentyeleven ed inserisco il codice php così come l'hai scritto o devo modificare qualcosa?

Esatto, non devi modificare nient'altro.

Fatto e funziona alla grande!
Ti ringrazio veramente per essere stato così disponibile