Ciao Uraja.

Come sempre bisogna pensare prima di tutto all'utente.

Per un utente che naviga in questo tuo sito, sarebbero utili tutti questi link? Li apprezzerebbe? Questo sistema è usabile?

Io credo di no, almeno così come lo hai descritto.
Molto meglio i tooltip.
Tipo quelli in questa stessa pagina: ci passi sopra col mouse e ti esce la definizione breve. Se vuoi approfondire clicchi e si apre una nuova scheda.
Ottimo!

Nel tuo caso hai una pagina unica per il glossario. OK.
Io addirittura metterei solo al passaggio del mouse la definizione e STOP! (non so se si può fare)
Molto veloce e usabile per l'utente.
Altrimenti il link al glossario (all'ancora del termine) che apre una nuova scheda.

Se lo stesso termine è presente più volte metterei soltanto sul primo il tooltip.

Anche io preferisco i glossari in un'unica pagina.
Mi sembrano più efficaci, facili e veloci da consultare.
Questo se hai delle definizioni medio-brevi.
Se però vuoi approfondire molto i vari termini (diverse frasi, immagini, etc.) allora convengono sicuramente i glossari divisi per pagine.

IMHO