Io credo che, se non hai ancora liquidato l'iva o magari sei stato a credito sino ad ora, tu debba semplicemente comunicare al cliente (per iscritto) che l'importo è sbagliato e quindi di correggerlo sulla sua copia della fattura. Tu farai altrettanto sulla tua copia ed in contabilità apporti la correzione. Altrimenti puoi scegliere la via delle note di credito come tu stesso hai detto.
Se hai fatto il versamento dell'IVA, probabilmente dovrai fare un ravvedimento.
Se magari qualcuno ha qualche esempio di una lettera di incarico ben realizzata e impaginata, sempre inerente al mondo dei servizi realizzazione siti o simile, se puo postarla o passarmi il link.
Inoltre,
se integro la lettera con il modello di contratto che ce qui nel forum(quello fornitura servizi),
potrebbe andare bene?