Apri il sito con IE 8 oppure con la versione che hai e correggi gli errori che ti segnala.
C'è un icona in basso a sinistra con un triangolino giallo. Il problema potrebbe essere in uno di quei javascript soprattutto se il sito è visibile con IE9. Le vecchie versioni di IE hanno la caratteristica di bloccare tutto l'output della pagina al minimo errore javascript (anche se non ne sono certo).

Ciao Susanna, scusami se rispondo solo adesso.

Per i cookie devi sempre usare jquery, prima devi scaricarti e installare il plugin per gestire i cookie che trovi qui: github.com/carhartl/jquery-cookie/tree/v1.4.1

Poi dove fai mostrare il disclaimer metti un'istruzione condizionale if, che se il visitarore è alla sua prima visita e non è stato ancora creato il cookie gli mostri il disclaimer e quando accetta crei il cookie in modo che la prossima volta che entra salterà la visualizzazione del disclaimer.

Qui trovi uno spunto su come usare i cookie con jquery: www. mrwebmaster.it/jquery/gestire-cookie-jquery_7638.html