è possibilissimo, puoi lavorare dove ti pare.
Probabilmente l'azienda vuole tutelarsi da possibili eventuali rivendicazioni in ordine agli istituti della trasferta.
Io, se assistessi l'azienda, le direi di indicare sul contratto di lavoro che la sede di lavoro è roma e allo stesso tempo farei fare a te un dichiarazione in cui affermi di essere residente a roma.
Prova a proporglielo.

Grazie mille