ciao,
premetto che non ho compreso bene la tua domanda
Ma si è rivelata al quanto interessante!
l'iframe serve per incorporare il contenuto di una pagina (url) A in una pagina B (url): le pagine sono ben distinte. Secondo quanto ne so, Google sconsiglia di utilizzare iframe e non segue i link in "src", Sono certo che se la pagina B non è già presente nell'indice di G., lui non la seguire/collezionera.
Andando a cercare delle informazioni ho trovato questa entry google.com/support/webmasters/bin/answer.py?answer=34445&query=iframe&hl=it
Che è alquanto ambigua sulla questione: "Google supporta frame e iframe nei limiti del possibile. ... Google cerca di associare i contenuti del frame con la pagina contenente i frame, ma non garantisce che questo verrà fatto."
Ma se la pagina B è già presente nell'indice? Nel momento che cerca di valutare la pagina A, accedendo alla pagina B richiamata via iframe, sta già necessariamente valutando il contenuto di B.
A questo punto, se B è "pertinente" a A (nel senso che gioca un ruolo importante per la rilevanza di A) perchè non considerare le due pagine connesse (e quindi passare una sorta di PR/valore)?
Sembra, dalla entry della guida, che G. si riservi il modo in cui gestire queste situazioni ....
A questo punto ti chiedo:
Hai dei backlink da delle pagine che rappresentano la tua pagina in iframe?
Se si, sei sicuro che i link sono via iframe?