Ok diciamo che ho risolto!
il file .htaccess l'ho strutturato così

RewriteEngine OnRewriteBase / RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d RewriteRule ^([^/]*)\.html$ /index.php?sezione=$1 [L,NC] RewriteRule ^generale/([^/]+)/?$ /index.php?sezione=generale&cat=$1

i link li ho messi con percorso assoluto
che terminano con:

/generale/miacategoria/

Ora mi può stare bene così, ma c'è un modo per eliminare generale? se lo faccio dalla regola non mi funziona più nulla!
in ogni caso mi sta bene anche così!!
grazie per il vostro aiuto, è stato fondamentale!!