Innanzitutto opterei per una srl anziché per una cooperativa.
In sede di costituzione della società, se intendi effettuare un conferimento in natura, quale sarebbe quello del sito web, per attribuire il valore occorre una perizia redatta da un esperto che nel caso delle srl può anche essere una persona di fiducia del socio che sia iscritto nel registro dei revisori contabili.
Comunque se vuoi qualche dritta per la valutazione di un sito web dai un'occhiata qui.
Saluti.