Ciao Marco,
forse dovresti partire da una distribuzione tipo ArchLinux che ti consente una grandissima personalizzazione iniziale (quando inizi hai solo il prompt da console) e poi configurare il tuo ambiente grafico preferito (che sia Gnome, KDE, KDEMod, XFCE......) con i tuoi programmi.
Per quanto riguarda la creazione di una distribuzione (io intendo il produrre un DVD di installazione) non mi sono mai interessato all'argomento e non posso aiutarti granchè. Ti segnalo un articolo:
faidaweb.it/2007/12/28/come-creare-una-distribuzione-linux/
Secondo me se non sei interessato alla diffusione del tuo linux, ma solo all'uso personale la via da prendere è quella di studiarsi una distribuzione madre e cambiarla in base alle proprie esigenze e per queste cose ti consiglio ArchLinux.
(www).archlinux.it
(www).archlinux.org
Se non sono stato chiaro o se non ho risposto alla tua domanda spiegami cosa intendi per "una distribuzione tutta mia".
Ciao!