Di nulla
Io non ho altre idee anche perchè non mi è mai capitato di trovarmi i ? al posto dei caratteri perchè anche provando in locale mi è sempre funzionato.
Mah misteri del php...:?

Non vedo nulla di sbagliato, non puoi tenere i caratteri speciali in entità html?

ma cosa usi per convertirli in xml?

dopo l'if all'inizio non va il punto e virgola

devi usare le entità html usa htmlentities() per convertirle prima di inserirle nel database (http://it.php.net/manual/it/function.htmlentities.php)