Problema risolto, mi sono portato i valori di alcune variabili sul frame di sinistra e su queste variabili ho fatto dei controlli javascript che evitano di far cambiare l'url del frame centrale se in esso non sono verificate delle condizioni.

Grazie ugualmente.

Leandro.

Ok !!! Risolto !!!
Ho dovuto memorizzare nella tabella anche il type del file ($_FILES['nome']['type']) così che quando apro il download riconosce subito il type del file....comunque c'era anche un errore nella :

$queryFile = "select NOMEFILEORGANIGRAMMA,FILEORGANIGRAMMA from ORGANIGRAMMACLIENTE where FK_PK_CODANAGCLI = '".$_GET["ID"]."'";

$selectFile=$mysqli->query($queryFile);

while ($rowCont = $selectFile->fetch_assoc()){
$data=$rowCont['FILEORGANIGRAMMA'];
$name=$rowCont['NOMEFILEORGANIGRAMMA'];
}

perchè non mi valorizzava bele le variabilie $data e $name.

Grazie a tutti comunque.