Ciao gio17 e benvenuto sul forum GT,
esiste una funzione php che fa proprio al caso tuo: strip_tags. Con questa funzione elimini in tutto (o in parte) i tag html.
Quello che secondo me ti conviene fare è una semplice query di tipo SELECT per leggere il contenuto e memorizzarlo in una variabile, ad esempio $testo, quindi scrivi:
$testo_pulito = strip_tags($testo);
ed infine fai una query di aggiornamento, quindi di tipo UPDATE, aggiornando il testo del db con $testo_pulito.
Facci sapere se ti riesce l'impresa...