Caio faxy,
i motivi possono essere davvero tanti.
I primi sono in assoluto sono la quantità di backlink dietro a ciascun sito e la frequenza di aggiornamento, ma possono influire anche fattori differenti.
In particolare la struttura di un blog facilità notevolmente l'indicizzazione dei contenuti, spesso a discapito del posizionamento dei post più anziani: l'ultimo articolo pubblicato ha grossa rilevanza in prima pagina, mentre il materiale più vecchio può trovarsi anche a molti clic di distanza dalla home.
È inoltre possibile che vi sia una differente gestione della Sitemap nella configurazione dei due cms o che per un motivo difficile da intuire Google abbia catalogato in maniera differente i due siti.
In ogni caso, soprattutto finché i domini sono nuovi, queste analisi devono essere fatte con molta prudenza.