L'errore è concettuale, non vi è alcun controllo su alcuna variabile che identifica se tutti i campi sono compilati o meno.
Quelli che hai specificato sono semplici if in successione, eseguito il terzo per lui è finito lo script e passa al successivo.
Devi interrompere il flusso eseguendo il controllo su una variabile che setti a true quando tutti i campi sono compilati e solo allora esegui il salva.

Ciao fabiox3 (Caro concittadino - quasi benvenuto sul forum Gt e un saluto anche al caro Mister.jinx

In linea di massima, se una pagina è raggiungibile da due url differenti, abbiamo contenuto duplicato. Nel tuo caso quindi, l'intero sito è completamente duplicato in due versioni .php e .html, bisogna solo aspettare che google se ne accorga. Per evitare questo dovresti correre ai ripari velocemente, levare la sitemap non è certo sufficiente, risolvi il problema alla radice.

Il problema ora è che Google ha iniziato a trovare le due versioni, vedi ad esempio questa e questa e probabilmente ne ha già trovato altre.