Ciao **elysa82 **,
il contratto tra aziende (o tra professionista e aziende) lo puoi fare assoultamente come vuoi essendo un contratto "privato" tra soggetti privati, anche se con P.IVA.
Importante è che non si configuri nessun rapporto di subordinazione, altrimenti si tratta di lavoro dipendente che è un'altra cosa. Consiglio, come prevede il TUIR, di non fare una fattura e poi aspettare di essere pagata, ma un avviso di fatturazione e poi una volta pagata emetti fattura. Questo magari scrivilo sul contratto che farai firmare al tuo cliente.

Per il collaboratore, se ho capito bene, sarebbe un tuo collaboratore giusto? Se il collaboratore è un dipendente devi fargli sottoscrivere un cosiddetto accordo di non divulgazione, specificando anche le eventuali penali o denunce alla magistratura per il reato di divulgazione di dati sensibili o privati non autorizzati.