Ciao, benvenuto :). Sicuramente ti riferisci non al bootstrap ma al boot (splash) screen con il logo di windows che appare durante il caricamento del sistema operativo. Esiste un metodo (e forse anche di più) per cambiarlo, e puoi trovare una descrizione qua:

http://www.jakeludington.com/windows_xp/20060219_change_xp_boot_screen.html

Naturalmente un conto è cambiare l'immagine, un conto è fare un'animazione. Leggi bene il documento che ti ho linkato.

Ciao