Fai una ricerca qui sul forum o anche su google, è un argomento trito e ri-trito!
Comunque... se le pagine sono state eliminate e non hai intenzione di ripristinarle lasciale così e google le toglierà dal suo indice, se invece sono state sostituite da altre ti consiglio un redirect 301.
Leggiti qualche articolo in proposito e avrai le idee più chiare