Se utilizzi php puoi provare la libreria minify che trovi a questo indirizzo: code.google.com/p/minify/
Ti rimuove gli spazi e i commenti, ti comprime il file e può anche combinare insieme eventuali files css e js.

Valerio Notarfrancesco

Certo, potresti anche realizzare qualcosa lato server che elabori la richiesta e prima di restituirla al client la modifichi a dovere.
Molto dipende dal linguaggio che usi; dovresti realizzare qualcosa ad hoc. Io ad esempio utilizzo java con struts e la cosa sarebbe abbastanza semplice.

Alternativa secondo me migliore è utilizzare qualche programma tipo dreamweaver per editare i file. Dico questo perchè dreamwaver così come molti altri editor html ti permettere di formattare il codice in modo automatico, e poi, prima di inviare i file al server, eliminare gli accapo.

Mi permetto di farti una domanda...
Perchè hai la necessità di scrivere tutto su una riga?